群体进化

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解析种群信息,揭示群体进化历程

群体进化研究是指通过全基因组重测序技术获得某物?#32959;?#28982;群体各亚群的基因组信息,
通过与参考基因组比对,得到大量高准确性的SNP、InDel、SV、CNV等变异信息,
然后基于群体变异信息,?#33268;?#32676;体的遗传结构、基因交流情况、物?#20013;?#25104;机制以及群体进化动态
等生物学问题, 从而从?#32959;?#23618;面深入研究该物种的进化历程。

追溯种群历史,寻找进化基因

基于全基因组重测序的群体进化研究,能够最大程度地挖掘出群体内的遗传变异,
可用来追溯群体的进化过程,挖掘进化基因,已广泛应用于许多物种的人工驯化机制研究、
自然选择机制分析和种群历史研究。具有重要的科学理论和实践应用价值。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,?#21592;U细?#36136;量研究成果。

信息分析

利用全基因组重测序技术获得物?#32959;?#28982;群体各
亚群的基因组信息,得到大量的SNP、InDel、
CNV等标记信息,随后基于SNP和CNV
标记探讨群体的遗传结构等生物学问题。

分析内容 解决问题
变异检测 准确定位 SNP、Indel、CNV 等变异位点
(Tree、PCA、Structure)
群体结构分析 构建系统进化树,进行 PCA 和遗传结构分析,确定样本间进化关系
遗传多样性分析 完成群体θ?#23567;ⅵ葁多态性参数的估算
选择性消除分析 不同群体进化过程中的选择性消除,揭示与选择相关的关键基因
基因功能注释与富集分析 统计候选基因?#26893;?#35268;律,寻找性状相关的功能基因
种群历史分析 ?#33268;?#26679;本支系之间的分化历史,结合历史?#24405;?#21487;以讲述非常动听的生物学故事
基因交流分析 为研究群体进化过程中的迁移?#24405;?#25552;供思路

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

群体进化研究采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
?#21592;?#35777;高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目?#26041;?/h3>

至2019年8月,诺禾致源已完成藏猪、金丝猴、绵羊、西域飞?#21462;?br/>桃子、小麦等几十个物种的群体进化研究,文章多发表于Nature Genetics、Nature Communications等国际顶级期刊。
“科学的方案设计,?#32454;?#30340;质控管理,专业的分析团队,丰富?#21335;?#30446;经验,优质?#21335;?#30446;服务?#20445;?br>确保每一个?#26041;?#37117;能出色完成,助力科学研究。

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